Protein–RNA interactions for Protein: Q8N319

C6orf223, Uncharacterized protein C6orf223, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223Q8N319 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf223Q8N319 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C6orf223Q8N319 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms