Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms