Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms