Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPUSD2Q8IZ73 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms