Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC170Q8IYT3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC170Q8IYT3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC170Q8IYT3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC170Q8IYT3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms