Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms