Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA4Q8IV77 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms