Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LCA5Q86VQ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LCA5Q86VQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LCA5Q86VQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LCA5Q86VQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LCA5Q86VQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LCA5Q86VQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LCA5Q86VQ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LCA5Q86VQ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LCA5Q86VQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms