Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms