Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDXQ7Z353 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms