Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRP9Q7RTR0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms