Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH2Q76I76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH2Q76I76 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH2Q76I76 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH2Q76I76 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH2Q76I76 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms