Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms