Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB1D4Q6XE38 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB1D4Q6XE38 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms