Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms