Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM1Q6UX27 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms