Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC137Q6PK04 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms