Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD3Q6PCD5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms