Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms