Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms