Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC70Q6NSX1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms