Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF6Q6KF10 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms