Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCSAPQ6IQ19 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSAPQ6IQ19 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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