Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD5Q6GMV2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD5Q6GMV2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD5Q6GMV2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD5Q6GMV2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD5Q6GMV2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD5Q6GMV2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD5Q6GMV2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms