Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CREB3L3Q68CJ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3L3Q68CJ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms