Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WSCD1Q658N2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms