Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms