Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LGSNQ5TDP6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LGSNQ5TDP6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms