Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6V5

C9orf64, Queuosine salvage protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf64Q5T6V5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf64Q5T6V5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf64Q5T6V5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms