Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CEP170Q5SW79 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CEP170Q5SW79 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms