Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP188Q5SRE5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP188Q5SRE5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms