Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC27A3Q5K4L6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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