Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF2Q5BJF6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms