Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC178Q5BJE1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms