Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms