Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM1Q2NKQ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms