Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ISXQ2M1V0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms