Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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