Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTL8BQ17RB0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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