Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP6Q16828 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms