Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK5Q16478 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK5Q16478 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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