Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SSX2Q16385 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSX2Q16385 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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