Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA3Q16281 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms