Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms