Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USF2Q15853 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USF2Q15853 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USF2Q15853 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USF2Q15853 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USF2Q15853 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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