Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA6Q15825 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA6Q15825 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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