Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NCOA1Q15788 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
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NCOA1Q15788 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
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NCOA1Q15788 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
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NCOA1Q15788 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
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NCOA1Q15788 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
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NCOA1Q15788 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
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NCOA1Q15788 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
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NCOA1Q15788 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
NCOA1Q15788 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
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