Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX1Q15699 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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