Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRADDQ15628 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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