Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTF1Q15361 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTF1Q15361 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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